يتحمل المدير المسؤولية الكاملة عن كل العمليات الإدارية المنجزة بمنظومة مدرستي، وعلى كاهله تثقل كل العمليات الإدارية المنجزة بها مثل تسجيل التلاميذ أو توزيعهم على أقسامهم أو تنزيل نتائجهم أو استخراج محاضر الجلسات ودفاتر المراسلات، وعليه فمن واجبه الاحتفاظ بكلمة العبور، والمحافظة على طابعها الشخصي والسري، وإذا منحها لأحد الأعوان الإداريين أو المدرسين فعلى مسؤوليته الخاصّة.
ويمكن مخاطبة الهياكل المركزية في الوزارة لتمكين الإداريين والمدرسين خاصّة من كلمات عبور خاصة بهم لتيسير عملية احتساب النتائج كل ثلاثية دون تلاعب أو تدليس.